Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CASQ1P31415 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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