Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AP005202.1-202ENST00000583065 748 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 IL31RA-208ENST00000611895 1171 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC003991.1-203ENST00000591739 719 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 DSTNP1-201ENST00000419906 465 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXD11P31277 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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