Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms