Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms