Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC5P28715 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms