Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCAP28676 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCAP28676 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCAP28676 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCAP28676 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms