Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms