Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms