Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APCP25054 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APCP25054 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APCP25054 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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APCP25054 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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APCP25054 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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APCP25054 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APCP25054 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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APCP25054 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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APCP25054 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APCP25054 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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