Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms