Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM27P14373 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms