Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC172P0C7W6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC172P0C7W6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms