Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFRP00533 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFRP00533 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFRP00533 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EGFRP00533 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EGFRP00533 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EGFRP00533 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EGFRP00533 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFRP00533 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFRP00533 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFRP00533 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFRP00533 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFRP00533 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFRP00533 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFRP00533 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFRP00533 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFRP00533 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms