Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms