Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPLO60437 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPLO60437 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPLO60437 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPLO60437 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPLO60437 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPLO60437 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPLO60437 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPLO60437 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PPLO60437 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPLO60437 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPLO60437 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPLO60437 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPLO60437 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPLO60437 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPLO60437 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPLO60437 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPLO60437 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPLO60437 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPLO60437 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPLO60437 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPLO60437 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPLO60437 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPLO60437 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPLO60437 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPLO60437 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PPLO60437 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPLO60437 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PPLO60437 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPLO60437 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPLO60437 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPLO60437 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPLO60437 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPLO60437 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPLO60437 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPLO60437 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms