Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD5O60279 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms