Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPAG9O60271 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SPAG9O60271 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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