Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms