Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOX15O60248 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX15O60248 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOX15O60248 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOX15O60248 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms