Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms