Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA2O43921 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms