Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HTRA2O43464 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms