Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms