Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K13O43283 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K13O43283 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms