Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3BO15066 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIF3BO15066 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms