Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms