Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms