Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTLL13PA6NNM8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms