Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms