Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms