Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms