Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WWV3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WWV3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms