Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 SHPRH-206ENST00000438092 6994 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 FBXL17-206ENST00000619412 4059 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CACNA1C-201ENST00000327702 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PTPRMP28827 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PTPRMP28827 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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