Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC1P12-201ENST00000436509 1314 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCO2-201ENST00000298876 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXT2-204ENST00000372107 937 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10U1P-201ENST00000414690 905 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCO2-202ENST00000416383 1272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010983.1-201ENST00000418387 1028 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51R1P-201ENST00000435309 952 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICC-201ENST00000445710 1055 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00894-207ENST00000452864 750 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL666P-201ENST00000460953 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117482.1-201ENST00000490933 911 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDGF1P3-201ENST00000493351 567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A5-207ENST00000494706 840 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126182.2-201ENST00000496098 339 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP96-201ENST00000514593 591 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV2D-14-201ENST00000522473 355 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005597.3-201ENST00000532369 799 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPEP6-201ENST00000546228 626 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133304.1-201ENST00000548199 549 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662884.1-201ENST00000559458 662 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL17A-204ENST00000570550 491 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL17B-204ENST00000571246 491 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010615.2-206ENST00000593653 556 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPA-AS1-202ENST00000594367 630 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027345.1-201ENST00000611900 500 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AD000813.1-201ENST00000624007 832 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024475.4-201ENST00000635144 1206 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A4-204ENST00000368716 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXNP1-201ENST00000397383 1051 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUS1P4-201ENST00000401550 585 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512430.3-201ENST00000405355 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPPIN-203ENST00000409554 998 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS19P1-201ENST00000415286 434 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591686.1-201ENST00000421878 766 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025262.1-201ENST00000434563 589 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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