Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC006499.1-201ENST00000511870 850 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 RASSF8-AS1-204ENST00000535436 1121 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 LACRT-203ENST00000547511 504 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P67-201ENST00000604027 926 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 LINC00635-221ENST00000609366 784 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC073488.5-201ENST00000631993 754 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 MIR3120-201ENST00000636555 81 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 NF1P7-201ENST00000612076 1530 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 TSSK4-201ENST00000287913 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 ATF3-204ENST00000366983 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 METTL8P1-201ENST00000428182 611 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC025262.1-201ENST00000434563 589 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 RN7SL201P-201ENST00000482306 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 LINC02024-203ENST00000496994 489 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMEM225BP0DP42 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms