Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 CDYLP1-201ENST00000419017 1458 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 LINC01568-201ENST00000554640 2544 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PPCS-204ENST00000372562 966 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AL592182.2-201ENST00000442477 858 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 OR11J5P-201ENST00000556889 934 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 TDRD12-201ENST00000421545 1317 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 TRBV28-201ENST00000390400 364 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 AL353052.1-201ENST00000428673 818 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 NR1I3-226ENST00000508740 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ARID4AP29374 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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