Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LINC01012-204ENST00000629732 2771 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ABCF2P1-201ENST00000465687 1867 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 SERPINB11-209ENST00000624518 573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PTPRMP28827 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PTPRMP28827 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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PTPRMP28827 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 BRDT-204ENST00000394530 3207 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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