Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TMCO5A-201ENST00000319669 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 UBE2D3-205ENST00000350435 711 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC00331-201ENST00000446391 376 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC01591-202ENST00000522279 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC008870.2-201ENST00000568262 1024 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC114810.1-201ENST00000607415 473 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CASP8-208ENST00000392266 1283 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TMEM199-202ENST00000395404 971 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC010983.1-201ENST00000418387 1028 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC245047.6-201ENST00000445444 617 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ENTPD1-AS1-206ENST00000449197 523 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC138089.1-201ENST00000450847 967 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PDE4DIP-208ENST00000464103 1055 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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