Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 MS4A12-205ENST00000537076 1019 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 NDFIP1P1-201ENST00000543144 525 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 BIN2P2-201ENST00000503900 1303 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 TERF1P4-201ENST00000399580 1115 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AP001781.2-201ENST00000529841 783 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CACNB2-214ENST00000612743 597 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AL390882.1-201ENST00000618821 594 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC016722.2-201ENST00000429761 1835 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 GABRR3-202ENST00000472788 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PLOD1Q02809 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms