Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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