Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms