Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM2AQ9Y2K7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms