Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms