Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms