Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms