Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms