Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms