Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms