Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms