Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A6Q9P2U8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms